Il Consiglio Direttivo di FSE si compone dei membri eletti ogni anno al Congresso e dei rappresentanti del Centro di Coordinamento, sito ad Amburgo, e dei Dipartimenti Tematici di FSE, quei dipartimenti semi-autonomi rispetto al network e responsabili dello sviluppo del lavoro su particolari tematiche, in maniera più strutturata rispetto ai tradizionali gruppi di lavoro.
Attualmente, esistono il Dipartimento Disabled Fans’ Rights, per la promozione dei diritti dei tifosi diversamente abili, e il Dipartimento Fans’ Embassies